Au besoin, le Comité directeur de la SSH peut instituer des commissions. Actuellement, il existe les commissions suivantes: Commission MGH Conseil Projet pilote sur l’histoire des abus sexuels dans le contexte de l’Église catholique romaine en Suisse depuis le milieu du 20ème siècle Conseil Projet de recherche «Sur le rôle des autorités d’assistance de la ville de Zurich dans le contexte des placements extrafamiliaux forcés et des mesures coercitives à des fins d’assistance»